全长16S扩增子测序。随着测序技术的发展，读长更长的三代测序技术被用到16S扩增子测序中。相比于基于短读长测序技术的16S扩增子测序，基于PacBio等三代测序技术的扩增子测序可以实现对16S rRNA基因全长序列的高精度测序，从而实现更准确的群落组成鉴定。因此，可以说全长16S扩增子测序是细菌的“第二代身份证”。而16S rRNA基因一直被作为微生物群落中细菌“身份”的分子标记。通过对16S rRNA基因特定区域进行扩增和测序，可以研究环境样品中微生物群落组成以及相对丰度。
细菌是一类细胞细短(直径约0.5μm，长度约0.5~5μm)，结构简单，胞壁坚韧，多以二分裂方式繁殖和水生性较强的原核生物。
