如果有以下情况，当事人是不能通过婚姻登记处办理协议离婚手续的：
(1)一方要求离婚，而另一方不同意离婚的，要求离婚的一方就只有向法院起诉要求离婚。
(2)一方当事人为精神病患者，被医院确诊为无民事行为能力的，只能由另一方向法院起诉要求离婚。
(3)双方要求离婚，但是对子女抚养、财产及债务处理等事项不能达成协议的，当事人只能通过法院解决双方的争议，解除婚姻关系。
(4)当事人根本没有办理结婚登记，婚姻登记处是不受理离婚申请的。1994年2月1日以前就存在的事实婚姻，只能到法院办理离婚手续，1994年2月1日以后，男女双方在一起生活的同居关系，可以自行解除，不需要到婚姻登记处或法院办理解除手续，只是双方有财产或子女抚养纠纷的，才可以向法院起诉解决。
(5)双方是在外国或港、澳、台地区登记结婚的，不论双方能否达成协议，只能通过法院诉讼的方式离婚。
一、何为事实婚姻如何解除
事实婚姻的存在形式有两种：一是符合结婚条件的事实婚姻；二是不符合结婚条件的事实婚姻。针对这两种情况，对已经形成的事实婚姻要有限制、有条件地予以承认。因此，关于事实婚姻能否自行解除，要分别三种情况认定：
（一）、凡是男女双方符合结婚条件，虽未办结婚登记，但长期共同生活，或生育子女，形成一种现实的、稳定的婚姻家庭关系的，则产生婚姻的法律效力，双方当事人应自觉承担社会责任，履行法定义务，不得自行解除，亦不允许同时与他人结婚。在这种情况下应在对子女和财产问题作出妥善处理的条件下到婚姻登记管理机关办理离婚登记；婚姻登记管理机关应予受理，并做调解和好工作，经调解和好的，则为其补办结婚登记；若调解无效，则登记离婚。如果一方要求离婚，或双方同意离婚，但对子女、财产等问题不能达成协议的，则应向人民法院起诉，由人民法院按离婚诉讼程序解决。按此种方式处理的事实婚姻，原则上只针对1994年《婚姻登记管理条例》颁行之前的事实婚姻。
（二）、凡是男女双方或一方不符合结婚条件，或同居生活时间不长的，则认定为非法同居，其婚姻关系无效。这种无效是自始无效，当事人可以自行解除，有关部门亦可强制其解除。
（三）、自行解除非法同居关系，如果发生子女抚养、财产分割、债务、儿童和无过错一方的利益出发，依照《民法典》关于离婚的规定、最高人民法院有关解除非法同居关系的解释意见和《最高人民法院关于适用若干问题的解释（一）处理》。
二、解除同居关系怎样操作
(一)1994年2月1日前符合结婚实质要件的按事实婚姻处理，之后如符合结婚实质要件的按同居关系处理。
同居关系中，由于在较早时间，法律亦承认事实婚姻，所以在处理该类纠纷时应当正确识别事实婚姻与同居关系。
未按《民法典》（2021年1月1日起实施）第1049条规定办理结婚登记而以夫妻名义共同生活的男女，起诉到人民法院要求离婚的，应当区别对待：
1、1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以前，男女双方已经符合结婚实质要件的，按事实婚姻处理；
2、1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以后，男女双方符合结婚实质要件的，人民法院应当告知其在案件受理前补办结婚登记；未补办结婚登记的，按解除同居关系处理。”据此可知，在1994年2月1日前，如果双方即已符合结婚的实质要件，即便其至今未办理结婚登记，按事实婚姻处理；如在1994年2月1日后，双方才符合结婚实质要件的，那么在未补办结婚登记的情况下，按同居关系处理。
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(二)仅解除同居关系，法院不予受理，但有配偶者与他人同居的除外。
即当事人无论因为什么原因只要求法院解除双方的同居关系的，法院不受理，双方当事人可自行分开即可。